[文本处理] [已解决]批处理怎样提取文本里的特定内容信息并判断另一个文本里是否存在该内容

sweet惜缘

data中的文件类似于下面，是一个drug，需要提取的是红色部分，一个是entry部分(其实就是药物的名字信息)，一个是pathway信息部分(有的没有pathway信息的以~代替)，有的然后把它的pathway信息与pathway文件中的比较，找到完全相同的，得到其前面的代码写到另一个txt中
ENTRY       D07670                      Drug
NAME        Chlormadinone (INN)
FORMULA     C21H27ClO3
EXACT_MASS  362.1649
MOL_WEIGHT  362.8903
ACTIVITY    Progestin
REMARK      ATC code: G03DB06
            Drug group: DG00469
TARGET      progesterone receptor agonist [HSA:5241] [KO:K08556]
  PATHWAY   hsa04114(5241)  Oocyte meiosis
            hsa04914(5241)  Progesterone-mediated oocyte maturation
INTERACTION  
STR_MAP     map07225  Glucocorticoid and meneralocorticoid receptor agonists/antagonists
            map07226  Progesterone, androgen and estrogen receptor agonists/antagonists
BRITE       Anatomical Therapeutic Chemical (ATC) classification [BR:br08303]
             G GENITO URINARY SYSTEM AND SEX HORMONES
              G03 SEX HORMONES AND MODULATORS OF THE GENITAL SYSTEM
               G03D PROGESTOGENS
                G03DB Pregnadien derivatives
                 G03DB06 Chlormadinone
                  D07670  Chlormadinone (INN)
            Target-based classification of drugs [BR:br08310]
             Nuclear receptors
              Estrogen like receptors
               3-Ketosteroid receptor
                progesterone receptor
                 Chlormadinone
                  D07670  Chlormadinone (INN)
DBLINKS     CAS: 1961-77-9
            PubChem: 51091972
            LigandBox: D07670
            NIKKAJI: J13.853C
ATOM        25
            1   C1z C    22.2255  -14.2313
            2   C1z C    21.0340  -14.8622
            3   C1x C    23.3470  -14.8622
            4   O1a O    23.3470  -13.5304
            5   C5a C    22.2255  -12.8295
            6   C1y C    21.0340  -16.2640
            7   C1x C    19.8424  -14.1612
            8   C1a C    21.0340  -13.5304
            9   C1x C    23.3470  -16.2640
            10  C1a C    21.0339  -12.1285
            11  O5a O    23.4170  -12.1285
            12  C1y C    19.8424  -16.9650
            13  C1x C    18.6508  -14.8622
            14  C1y C    18.6508  -16.2640
            15  C2x C    19.8424  -18.2968
            16  C1z C    17.4592  -16.8949
            17  C2y C    18.6508  -18.9977
            18  C2y C    17.4592  -18.2968
            19  C1x C    16.2676  -16.1939
            20  C1a C    17.4592  -15.5631
            21  X   Cl   18.6507  -20.3295
            22  C2x C    16.2676  -18.9977
            23  C1x C    15.0760  -16.8949
            24  C5x C    15.0760  -18.2968
            25  O5x O    13.8844  -18.9977
BOND        28
            1     1   2 1
            2     1   3 1
            3     1   4 1 #Down
            4     1   5 1 #Up
            5     2   6 1
            6     2   7 1
            7     2   8 1 #Up
            8     3   9 1
            9     5  10 1
            10    5  11 2
            11    6  12 1
            12    7  13 1
            13   12  14 1
            14   12  15 1
            15   14  16 1
            16   15  17 2
            17   16  18 1
            18   16  19 1
            19   16  20 1 #Up
            20   17  21 1
            21   18  22 2
            22   19  23 1
            23   22  24 1
            24   24  25 2
            25    6   9 1
            26   13  14 1
            27   17  18 1
            28   23  24 1

pathway中大概是这样的
1. Metabolism
1.0.1        Global and overview maps
1.0.2        Metabolic pathways
1.0.3        Biosynthesis of secondary metabolites
1.0.4        Microbial metabolism in diverse environments
1.0.5        Biosynthesis of antibiotics
1.0.6        Carbon metabolism
1.0.7        2-Oxocarboxylic acid metabolism
1.0.8        Fatty acid metabolism
1.0.9        Biosynthesis of amino acids
1.0.10        Degradation of aromatic compounds  
1.1  Carbohydrate metabolism
1.1.1        Glycolysis / Gluconeogenesis
1.1.2        Citrate cycle (TCA cycle)
1.1.3        Pentose phosphate pathway
1.1.4        Pentose and glucuronate interconversions
1.1.5        Fructose and mannose metabolism
1.1.6        Galactose metabolism
1.1.7        Ascorbate and aldarate metabolism
1.1.8        Starch and sucrose metabolism
1.1.9        Amino sugar and nucleotide sugar metabolism
1.1.10        Pyruvate metabolism
1.1.11        Glyoxylate and dicarboxylate metabolism
1.1.12        Propanoate metabolism
1.1.13        Butanoate metabolism
1.1.14        C5-Branched dibasic acid metabolism
1.1.15        Inositol phosphate metabolism  
1.2 Energy metabolism
1.2.1        Oxidative phosphorylation
1.2.2        Photosynthesis
1.2.3        Photosynthesis - antenna proteins
1.2.4        Carbon fixation in photosynthetic organisms
1.2.5        Carbon fixation pathways in prokaryotes
1.2.6        Methane metabolism
1.2.7        Nitrogen metabolism
1.2.8        Sulfur metabolism  

最后得到的txt中的格式应该是这样的
ENTRY           PATHWAY
D00011           1.2.8
D00019           ~（没有的）
D00090          1.1.9，1.2.7（这种是有两个pathway信息的，如上，则两个用逗号隔开）

pcl_test

打包上传data和pathway两个文件的完整版本，文件过大可发网盘地址

sweet惜缘

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已上传。谢拉

sweet惜缘

回复 2# pcl_test

data中是不完整的数据集


非常感谢

sweet惜缘

求各位大神解答，要是有哪里不明白，我可以解答

sweet惜缘

。。。。大神都去过母亲节了么

bailong360

# 2>nul&@gawk -f %0 drug>$New.txt&exit
BEGIN{
  printf("ENTRY           PATHWAY\n")
  while((getline<"pathway.txt")>0) {split($0,tmp," ");pathway[substr($0,match($0,"[	 ]")+1)]=tmp[1]}P="~"
}
{
if($1~"///") {
  printf("%-15s %s\n",E,P);P="~"
} else if($1~"ENTRY") {
  E=$2
} else if(GoOn==0&&$0~/[a-z]+[0-9]+/&&$0!~"COMMENT") {
  temp=pathway[substr($0,index($0,")")+3)];if(temp!=0) P=P!="~"?P" "temp:temp
} else if($0!~/[a-z]+[0-9]+/) {
  GoOn=1
} else if($0~"PATHWAY") {
  temp=pathway[substr($0,index($0,")")+3)]
  if(temp!=0)P=P!="~"?P" "temp:temp;GoOn=0}
}
复制代码

sweet惜缘

回复 7# bailong360
    又是你~~~~感谢！！母亲节快乐

sweet惜缘

回复 7# bailong360

亲测有效~~一万个赞~~~

bailong360

回复 8# sweet惜缘
我是男的......
问题解决后，请编辑顶楼帖子在标题前面注明[已解决]
http://www.bathome.net/thread-3473-1-1.html